استخراج DNA از گونه های ماکرو جلبکی حاوی میزان بالای ترکیبات پلی ساکاریدی و فنولی جهت مطالعات ژنتیکی
نویسندگان
چکیده مقاله:
استخراج DNA خالص و کافی از ماکرو جلبک‌ها به علت دارا بودن رنج وسیعی از متابولیتهای ثانویه، نحوه اشتباه نمونهبرداری و خصوصیات مرفولوژی کی آنها، معمولاً مشکل است. ازآنجاکه استخراج DNA خالص جهت مطالعات مولکولی از اهمیت ویژهای برخوردار است این مطالعه باهدف استخراج آسان و ارزان DNA ژنومی باکیفیت و کمیت بالا از نمونههای ماکرو جلبکی انجام شد. استخراج DNA توسط روشهای فنول-کلروفرم، CTAB و CTAB تغییریافته انجام شد و همچنین نیتروژن مایع جهت خرد کردن نمونهها حذف گردید. درروش CTAB تغییریافته، تغییراتی در نسبت حجم بافر استخراج به نمونه، ترکیبات بافر استخراج (افزایش غلظت EDTA، بتامرکاپتواتانول و افزودن PVP و سارکوسیل) ایجاد شد. واکنش PCR بر اساس ژن tufA جهت اطمینان از خلوص DNA انجام شد. در ارزیابی کمی و کیفی DNA استخراجی، نسبت 280/260 نانومتر بین 84/1-7/1 و نسبت 230/260 نانومتر بیشتر از 2 نشان داده‌شده و همچنین غلظت DNA بین 8-5/6 میکروگرم بر میکرو لیتر اندازهگیری شد. محصولات PCR باندهایی را در محدوده 700-800 جفت باز در ژل آگارز نشان دادند. ارزیابی کمی و کیفی دادهها، خلوص و میزان بالای DNA استخراج‌شده به روش CTAB تغییریافته نسبت به دو روش دیگر را نشان دادند، به‌طوری‌که نسبتها نشاندهنده عاری بودن DNA از ترکیبات پروتئینی و پلیفنولی/ پلیساکاریدی است. ازآنجاکه آلودگیهای پلیساکاریدی و فنولی بازدارنده آنزیمهای واکنش PCR هستند بنابراین نتایج موفقیت‌آمیز واکنش PCR نشاندهنده خلوص DNA استخراج‌شده و کاربرد آن در مطالعات مولکولی است.DNA استخراج‌شده به روش بهینه‌شده در این مطالعه مناسب جهت مطالعات مولکولی و نگهداری است.
منابع مشابه
استخراج dna از گونه های ماکرو جلبکی حاوی میزان بالای ترکیبات پلی ساکاریدی و فنولی جهت مطالعات ژنتیکی
استخراج dna خالص و کافی از ماکرو جلبک ها به علت دارا بودن رنج وسیعی از متابولیتهای ثانویه، نحوه اشتباه نمونهبرداری و خصوصیات مرفولوژی کی آن ها، معمولاً مشکل است. ازآنجاکه استخراج dna خالص جهت مطالعات مولکولی از اهمیت ویژهای برخوردار است این مطالعه باهدف استخراج آسان و ارزان dna ژنومی باکیفیت و کمیت بالا از نمونههای ماکرو جلبکی انجام شد. استخراج dna توسط روشهای فنول-کلروفرم، ctab و ctab تغی...
متن کاملمعرفی یک روش جهت استخراج DNA از اکتینومایست های هوازی
سابقه و هدف: استخراج DNA از اکتینومیست های هوازی به دلیل پیچیدگی ساختمان دیواره سلولی آنها با روش های روتین برای استخراج DNA متفاوت است. در این مطالعه از روش جوشاندن به همراه محلول STET buffer برای استخراجDNA از این باکتری ها استفاده گردید. مواد و روش ها: با استفاده از محلول STET buffer ، ژنوم میکروارگانیسم ها استخراج گردید. کیفیت و کمیت DNA استخراج شده، با استفاده از اسپکتروفوتومتر و الکتر...
متن کاملمقایسه روشهای مختلف استخراج RNA کل از سه گونه آویشن غنی از ترکیبات فنولی و متابولیتهای ثانویه
گیاهان دارویی منبع غنی از مواد مؤثره برای تولید فراوردههای دارویی هستند. جنس آویشن (Thymus) متعلق به خانواده نعناعیان است که بیش از 18 گونه آن در نواحی مختلف ایران پراکنش دارند. اثرات دارویی این گیاه مربوط به ترکیبات مختلف ازجمله مونوترپنهای فنولی کارواکرول و تیمول است، اما این ترکیبات فنولی و متابولیتهای ثانویه دیگر بهعنوان مشکل اصلی استخراج RNA مناسب برای تجزیه و تحلیل بیان ژن و مهندسی ژن...
متن کاملمقایسه روش های مختلف استخراج rna کل از سه گونه آویشن غنی از ترکیبات فنولی و متابولیت های ثانویه
گیاهان دارویی منبع غنی از مواد مؤثره برای تولید فراوردههای دارویی هستند. جنس آویشن (thymus) متعلق به خانواده نعناعیان است که بیش از 18 گونه آن در نواحی مختلف ایران پراکنش دارند. اثرات دارویی این گیاه مربوط به ترکیبات مختلف ازجمله مونوترپنهای فنولی کارواکرول و تیمول است، اما این ترکیبات فنولی و متابولیتهای ثانویه دیگر بهعنوان مشکل اصلی استخراج rna مناسب برای تجزیه و تحلیل بیان ژن و مهندسی ژن...
متن کاملتاثیر شرایط عصاره‌گیری به کمک فراصوت بر میزان استخراج ترکیبات فنولی و فلاونوئیدی از میوه سنجد زینتی (Elaeagnus umbellate)
مقدمه: گیاهان منبع غنی از ترکیبات فنلی (اسیدهای فنلی، فلاونوئیدها و تاننها) هستند که مهمترین آنتیاکسیدانهای طبیعی به شمار میآیند. هدف از تحقیق حاضر بررسی تاثیر دو شیوه استخراج با فراصوت اعم از پروب و حمام، بر میزان استخراج ترکیبهای فنولی، فلاونوئیدی و قدرت مهار رادیکالهای آزاد DPPH از میوه سنجد زینتیبا استفاده از سه حلال استخراجی آب، متانول80% و اتانول70% بود. مواد و روشها: در دو روش ح...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 7 شماره 4
صفحات 67- 78
تاریخ انتشار 2016-01
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023